基于5.8S rDNA-ITS序列的我国浙江沿海铜藻群体遗传多样性分析

doi:10.3969/j.issn.1005-3395.2013.02.008

科研成果详情

题名	基于5.8S rDNA-ITS序列的我国浙江沿海铜藻群体遗传多样性分析
其他题名	Genetic Analysis Based on 5.8S rDNA-ITS Sequence of Sargassum horneri (Turner) C. Agardh in the Coastal Areas of Zhejiang Province, China
作者	蔡一凡1,2,3,4; 张鹏 3,4; 王铁杆 3,4; 陈少波1,2,3,4; 谢起浪1,2,3,4
发表日期	2013-03-15
发表期刊	热带亚热带植物学报影响因子和分区
语种	中文
原始文献类型	学术期刊
关键词	铜藻 5.8S rDNA-ITS 遗传多样性浙江沿海
摘要	为了调查我国浙江沿海铜藻(Sargassum horneri)群体遗传多样性,对浙江省南麂岛火焜岙、洞头岛、枸杞岛的野生群体和南麂岛马祖岙养殖群体的铜藻44个样品的5.8S rDNA-ITS序列进行了PCR扩增和序列分析,获得DNA片段长度为1485 bp,包括部分ITS1、完整的5.8S rDNA和部分ITS2序列。序列分析表明仅有1个变异位点,说明群体间没有明显的遗传分化,遗传多样性较低。另外,将包含这一变异位点的基因型与GenBank公共数据库中另外2株铜藻的5.8S rDNA-ITS区序列进行比对,共有31个变异位点,其中插入/缺失位点10个。因此,建议加快人工铜藻场的建设以及野生铜藻场的恢复,保持铜藻场的生态平衡。
其他摘要	The purpose was to investigate genetic diversity of Sargassum horneri populations in the coastal areas of Zhejiang Province, China. The 5.8S rDNA-ITS sequences from 44 individuals of S. horneri were amplified by PCR and analyzed, including wild populations from Huokun’ao of Nanji Island, Dongtou Island and Gouqi Island and Mazuao cultured population from Nanji Island in Zhejiang Province. The whole-length of sequence from all individuals was 1485 bp, including partial ITS1, ITS2 sequences, and complete 5.8S rDNA sequence. Among them, there was only one variable nucleotide site. It was suggested that there was no distinct genetic differentiation among populations with relatively low genetic diversity. In addition, 5.8S rDNA-ITS sequences from two haplotypes with the only one variable nucleotide site and another two sequences from GenBank public database were aligned, 31 variable nucleotide sites were detected, and 10 of them were insert or delete sites. Therefore, it was proposed to speed up the construction of artificial S. horneri field and restore wild S. horneri field in order to maintain an ecological balance.
资助项目	国家海洋公益性行业科研专项经费项目（201105008）;浙江省海洋与渔业项目;浙江省省属科研院所扶持专项计划项目（2012F20028）资助
ISSN	1005-3395
卷号	21 期号:02 页码:147-154
DOI	10.3969/j.issn.1005-3395.2013.02.008
页数	8
收录类别	CNKI ; 万方 ; 北大核心 ; PKU ; CSCD ; ISTIC
学科领域	医药、卫生 ; 中国医学 ; 肿瘤学
URL	查看原文
CSCD记录号	CSCD:4823868
引用统计
文献类型	期刊论文
条目标识符	https://kms.wmu.edu.cn/handle/3ETUA0LF/65989
专题	检验医学院（生命科学学院、生物学实验教学中心）检验医学院（生命科学学院、生物学实验教学中心）_海洋生物技术系
作者单位	1.温州医学院生命科学学院; 2.温州医学院海洋科学研究所; 3.浙江省海洋水产养殖研究所; 4.浙江省近岸水域生物资源开发与保护重点实验室
第一作者单位	检验医学院（生命科学学院、生物学实验教学中心）; 海洋生物技术系
第一作者的第一单位	检验医学院（生命科学学院、生物学实验教学中心）
推荐引用方式 GB/T 7714	蔡一凡,张鹏,王铁杆,等. 基于5.8S rDNA-ITS序列的我国浙江沿海铜藻群体遗传多样性分析[J]. 热带亚热带植物学报,2013,21(02):147-154.
APA	蔡一凡, 张鹏, 王铁杆, 陈少波, & 谢起浪. (2013). 基于5.8S rDNA-ITS序列的我国浙江沿海铜藻群体遗传多样性分析. 热带亚热带植物学报, 21(02), 147-154.
MLA	蔡一凡,et al."基于5.8S rDNA-ITS序列的我国浙江沿海铜藻群体遗传多样性分析".热带亚热带植物学报 21.02(2013):147-154.

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