双标记TaqMan探针实时荧光PCR法检测ALDH2基因型及初步临床应用

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题名	双标记TaqMan探针实时荧光PCR法检测ALDH2基因型及初步临床应用
其他题名	Double-labeled TaqMan probes-based real-time PCR for detecting ALDH2 genotypes and its preliminary clinical application
作者	陈占国 1; 余坚1; 金速速1; 谢振迪1; 阮积晨2
发表日期	2018-02-10
发表期刊	中国卫生检验杂志影响因子和分区
语种	中文
原始文献类型	学术期刊
关键词	线粒体乙醛脱氢酶2 基因型实时荧光PCR 硝酸甘油酒精
其他关键词	Aldehyde dehydrogenase 2 ; Genotype ; Real-time PCR ; Nitroglycerin ; Alcohol
摘要	目的评价双标记TaqMan探针实时荧光PCR法(dFQ-PCR)检测ALDH2基因型的可行性,并初步用于临床检测。方法对ALDH2基因型检测的dFQ-PCR进行方法学性能评价,包括准确度、检测下限、重复性和抗干扰能力,并在200例体检者中进行基因型检测。结果 ALDH2基因分型只需单管PCR扩增,操作简单,结果判断直观。与测序方法比较,准确性为100%,检测下限接近5 ng/μl,重复性好,常规浓度的干扰物均对基因型检测无干扰。本院200例体检者的GG、AG和AA基因型比例分别为60.0%、35.0%和4.5%,G和A等位基因频率分别为77.8%和22.2%,符合Hardy-Weinberg遗传平衡。结论 ALDH2基因型的dFQ-PCR检测方法单管扩增检测,具有操作简便快捷、结果判断简单、方法性能良好和所用仪器普及高等优点,适用于临床上大样本的ALDH2基因分型。
其他摘要	Objective To evaluate the feasibility of double-labeled TaqMan probes-based real-time PCR assay (dFQ-PCR) for detecting ALDH2 genotypes and apply it for clinical detection.Methods Methodological performances of dFQ-PCR for detecting ALDH2 genotypes,including the accuracy,limit of detection (LOD),repeatability and anti-jamming capability were evaluated.Meanwhile,the genotypes of 200 clinical samples from health examination were determined by dFQ-PCR.Results dFQ-PCR assay,which was a simple,rapid,and intuitive assay,can be performed in a single reaction to determine ALDH2 genotypes.Meanwhile,the accuracy was 100％ compared with the sequencing method.The LOD reaches 5 ng/μl and the method also showed a high repeatability.Moreover,the genotyping results were not interfered with the conventional interfering substances in blood.The genotype frequencies of GG,AG and AA from 200 physical examination people in local area were 60.0％,35.0％ and 4.5％,respectively,and the G and A allele frequencies were 77.8％ and 22.2％,respectively,which were in accordance with the genetic balance of Hardy-Weinberg.Conclusion The ALDH2 genotyping of dFQ-PCR in a single reaction has the advantages of easy operation,simple analysis,reliable performance and instrumental versatility,which is suitable for ALDH2 genotyping of batch clinical samples.
资助项目	浙江省医药卫生科技计划项目（2017KY112）;温州市公益性科技计划项目（Y20170201）;温州医科大学附属第二医院博士科研启动基金项目
ISSN	1004-8685
卷号	28 期号:03 页码:261-265
页数	5
收录类别	CNKI ; 万方 ; 维普 ; PKU ; 北大核心 ; ISTIC
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文献类型	期刊论文
条目标识符	https://kms.wmu.edu.cn/handle/3ETUA0LF/47566
专题	附属第二医院附属第二医院_儿童血液科
作者单位	1.温州医科大学附属第二医院检验医学学科; 2.温州医科大学附属第二医院儿童血液科
第一作者单位	附属第二医院
第一作者的第一单位	附属第二医院
推荐引用方式 GB/T 7714	陈占国,余坚,金速速,等. 双标记TaqMan探针实时荧光PCR法检测ALDH2基因型及初步临床应用[J]. 中国卫生检验杂志,2018,28(03):261-265.
APA	陈占国, 余坚, 金速速, 谢振迪, & 阮积晨. (2018). 双标记TaqMan探针实时荧光PCR法检测ALDH2基因型及初步临床应用. 中国卫生检验杂志, 28(03), 261-265.
MLA	陈占国,et al."双标记TaqMan探针实时荧光PCR法检测ALDH2基因型及初步临床应用".中国卫生检验杂志 28.03(2018):261-265.

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ZWJZ201803002.CAJ（1468KB）	期刊论文	出版稿	开放获取	CC BY-NC-SA	浏览下载